绍兴市柯桥区疾病预防控制中心成立于2002年4月，前身为始建于1954年10月的绍兴县卫生防疫站，2013年11月因行政区划调整由绍兴县疾病预防控制中心更名为绍兴市柯桥区疾病预防控制中心。2024年7月，因疾控体系改革，整合绍兴市柯桥区疾病预防控制中心、绍兴市柯桥区卫生健康行政执法队职责，重新组建绍兴市柯桥区疾病预防控制中心，挂绍兴市柯桥区卫生监督所牌子，为绍兴市柯桥区卫生健康局（挂绍兴市柯桥区疾病预防控制局牌子）管理的公益一类事业单位。中心主要承担辖区内疾病预防控制、突发公共卫生事件应急处置、疾病与健康危害因素等公共卫生信息管理；健康危害因素监测与评价、实验室检测检验、健康促进与教育、疾病预防控制和卫生监督工作的业务技术指导；承担医疗卫生、公共卫生、传染病防控、职业卫生等卫生监督执法工作。此外，绍兴市柯桥区公共卫生工作委员会精神卫生办公室、绍兴市柯桥区儿童窝沟封闭项目领导小组办公室、绍兴市柯桥区基本公共卫生服务项目管理办公室均设在中心内。

 中心内设机构15个，核定编制149 名（含参照公务员法管理事业编制61名）。目前在编人员133人（参公52人），在编事业人员均为专业技术人员，其中高级职称18人，中级职称26人；硕士研究生及以上学历18人，本科学历109人。

 多年来，在柯桥区委、区政府的高度重视和省、市、区卫生行政部门的指导帮助下，我区疾控体系建设取得了长足的发展，“五员”疾控体系的融合更是促进疾病控制和监督执法能力迈向新的台阶。中心指导组建并管理着覆盖全区的卫生应急和慢性病防控网络，是柯桥区“省级卫生应急工作示范区”、“省级慢性病综合防控示范区”的主要组织实施者。注重“互联网+监管”，采用数智化卫生监督执法手段，查办的多起案件入选省级、市级典型案例，卫生监督行政执法质效稳步提升。

 中心是“绍兴市文明单位”，曾获“全国疾病预防控制工作先进集体”、“中国糖尿病并发症研究项目先进集体”、“绍兴市抗击新冠肺炎疫情先进集体”、“绍兴市卫生健康行政执法先进单位”、“柯桥区先进单位”、“柯桥区专项奖励集体三等功”等荣誉称号。多年来，积极倡导“和谐、务实、创新、奉献”的单位精神，坚持“预防为主、防控结合”的工作方针，秉承“依法监管、服务社会”的工作理念，努力为柯桥区的经济发展提供健康环境，为和谐社会的构筑作出健康保障。